BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od **Faskal** » 12. 10. 2007, 20:25

Trocha propagace biologům:
Inner life of the cell

Na požádání vysvětlím, cože to vidíte za struktury...

maYda · Příspěvek od **maYda** » 12. 10. 2007, 22:29

ÚÚÚÚžasný, co dokáže ta počítačová animace.

Při té příležitosti jsem si vzpomněla na film, o kterém jsem četla, ale nikdy se mi nepoštěstilo ho vidět.
http://www.kfilmu.net/filmy.php?sekce=i ... HPSESSID=2

je z roku 1966 a docela by mně zajímalo, jak si poradili bez animace.

A co to je teda za struktury?

Příspěvek od **Faskal** » 12. 10. 2007, 23:37

O tom filmu jsem taky slyšel, ale tu čest jsem též neměl...

No, to jsou různé vnitřní buněčné struktury... Jestli chceš, můžu ti je identifikovat (naznačit, co to je a k čemu je to dobré) vše, co se tam mihne... Nebo se jinak se klidně zeptej n něco konkrétného...

Celkově jde o bílou krvinku, která se vydává za zánětem

Jerson · Příspěvek od **Jerson** » 13. 10. 2007, 09:49

moc hezký filmeček - komentář by se hodil ke všemu, ale úplně nejvíc me zajímá, co je to za strukturu, která vypadá jako velký modrý balon v vyčnívajícím ocáskem, který má na konci rozdvojení, pomocí kterého "chodí" po vláknech a táhne ten balón za sebou. A hlavně jak funguje mechanismus toho "kráčení" - nebo jak funguje mechanismus spojování buněk do dlouhých vláken, kde každá buňka vypadá, jako by věděla kam se má přiřadit (a vůbec mi není jasné, jakým způsobem se na to místo dostane)

maYda · Příspěvek od **maYda** » 13. 10. 2007, 12:11

Mně by zas zajímalo, co to je za strukturu, která se skládá z drobných segmetů do jakési trubky a hned se zase stejným způsobem rozpadá. Proč ten růst a hned na to rozpad.

Příspěvek od **Faskal** » 13. 10. 2007, 12:40

Ani nevíte, jakou mám z vás radost...
V brzku vám to popíšu všechno, teď jen dotazy (a i ty jen ve skratce):
modrý balón je váček, který je tažen "motorovým proteinem", jde o změny konformace molekul při dodání energie
Ta trubičkovitá struktura je cytoskelet: Dutý je složen z tubulinu, ten "šroubovitý" z aktinu... Má hromadu a hromadu funkcí, spousta z nich je ve filmu vidět

Pak vám to popíšu,
but now:
I have never wanted to do this... I always wanted to be...
a lumberjack!
ale teď se jde štípat dřevo

Sosacek · Příspěvek od **Sosacek** » 13. 10. 2007, 12:41

a chtel jsi nosit vysoky podpadky a zensky saty?

(kdo to pochopi, ma u me lizatko!)

maYda · Příspěvek od **maYda** » 13. 10. 2007, 13:08

faskale, odmrazuju ledničku, s radostí bych šla radši štípat dřevo.
Nechceš to čenžnout?

Příspěvek od **Faskal** » 13. 10. 2007, 17:28

Hm, maYdo, víš, že já bych moc neměnil? Miluji štípání dřeva... Člověk se fantasticky odreaguje.

Inu, Sosáčku, kyvadlo mi říká, že mám lízátko...

Úvod: Na začátku je vidět krevní řečiště. To červené jsou... červené krvinky, to modré - bílé krvinky, které se valí po stěnách.

Přichycení buněk: V dalším záběru je detail, jak se bílá krvinka chytá k buňce. V přiblížení jdou vidět modré proteiny patřící leukocytu (bílá k.) a zlaté patří buňce. Navzájem do sebe "pasují", proto se přichytí.

Cesta po membráně:
Po vrstvě modrých předmětů (buněčná membrána) klouže vyšší vrstva jim podobných, která nese proteiny. Jde o "raft" čili vor. To je struktura tvořená pospojovanými fosfolipidy, které jsou delší než většina ostatních fosfolipidů tvpřících membránů a jako celek stabilnější. Táhne je pravděpodobně něco na druhé straně membrány. (můj oblíbený záběr je, jak se houpou). Je to zřejmě vně buňky, kde je spousta extracelulárních (mimobuněčných) proteinů a cukrů.

Membárna zespodu:
Toto je už uvnitř buňky (přechod nějak přešli), kolem je nějaký cytoskelet

Vzdalování od membrány:
Jsou tam takové divně, většinou trojúhelníkové struktury. Jde o cytoskelet, konkrétně aktinová vlákna, která zpevňují buňku a rozdělují membránu na několik částí.

Sestup do buňky:
Opět "buněčná kostra" - cytoskelet - dlouhá vlákna navzájem pospojovaná - aktin (vytváří pavučinovou strukturu), ty můstky z světlejší barvy jsou nějaký jiný typ vláken (filament), které to vše stabilizují.

Fialové vlákno se skládá.
Tak to je zřejmě aktin, nebo jiný filament, která se dokáže samovolně skládat. Vidíte podjednotky, které k sobě přiskakují a vytváří tu šroubovici. Je to dost zjednodušené, protože buňka je vykreslená strašně prázdná... Ve skutečnosti takové věci plavou úplně všude a skládají se vždy, když mohou... Stejně tak se náhodně rozkládají. Důležité je, že na jednom konci se hlavně skládají a na druhém spíš rozkládají. Pokud se tedy ten rozkládající se konec přichytnete, vlákno poroste

Zelená molekula se přichycuje na modré vlákno.
To je zřejmě polypeptid, který se váže na filamenta a rozbíjí je na části. O něco později bude vidět, jak se začou rozpojovat z druhé strany, protože tato strana je stabilizována tou věcí (říká se jí, nevím, nakolik oficiálně "katastrofin")

Skládání dutých trubiček:
polymerace mikrotubulů - další typ cytoskeletu (v bičících, dlouhá a pevná vlákna, v jádře, o něco dál se zase rozkládá) jednotlivá část je složena ze dvou podjednotek, musí být vhodně orientované...

Motorový protein nese modrý váček.
Jedno z nejúdernějších míst animace...
Motorové proteiny, které se skládají z místa, které se váže specificky na nějakou molekulu (třeba povrch váčku), spojovacího krčku a samotné pohyblivé části kráčící po mikrotubulu. Ta má dva konce, které mohou po dodání energie měnit svou strukturu. Ve chvíli, kdy je "noha" vzadu, dodá se ATP (univerzální zdroj energie), sníží se vazba k mikrotubulu+změnou konformace se udělá "krok" vpřed =>změnou konformace při kroku se uvolní ADP (molekula po odebrání energie) a zvýší se schopnost znovu se navázat na tubulin =>pevně se přisedne. A tak to chodí (je jich několik typů a vždy jdou jen jedním směřem, až na jednu výjimku, dyneiny, které chodí doprotisměru) .
Po chvíli se v hloubce objevuje jádro, vidět tam jsou dva válce - dělicí vřeténko (je to také organizační centrum mikrotubulů - většina vybíhá odtamtud... je to nějak divně vidět, vypadá to, jako by směřovaly spíš do středu jádra) Vpravo od jádra, taková ta vrstevnatá věc bude zřejmě Golgiho komplex, kde se dál upravují nasyntetizované věci. Ta nafialovělá věc může být cokoliv (snad mitochondrie? I když jsem si rozbil svou původní představu a znovu ji zatím moc neposkládal)...

Povrch jádra:
Jdou vidět jaderné póry, ze kterých vylézá mRNA nesoucí informaci o budoucím proteinu z jádra do cytoplasmy (je tu kouzelná hudba)

Syntéza bílkoviny:
mRNA se spojí do kruhu (nevím proč...), nasedne na něj velká podjednotka ribozomu, projede úvodní (poly-A) sekvence, a čeká na malou podjednotku... Ribozom jede po RNA a syntetizuje (většinou jich tam sedá mnohem víc)

Spojení dvou protejnů
Modrý a červený (většina proteinů se ještě po syntéze upravuje)

Ribozom na něco dosedá
To je "drsné endoplazmatické retikulum" drsné proto, že na něm sedí spousta ribozomů, které do ní soukají bílkoviny. Zde je hlavní místo úpravy proteinů

Odštěpování váčků
jsou ze stejného materiálu jako všechny membrány

Základna ufonů
Golgiho komplex - centrum prodalší úpravy proteinů (dodávání cukerných zbytků a práce s tuky, koordinace vypouštění látek do mezibuněčného prostoru)

Splynují váčku s hlavní membránou buňky
To, co bylo původně ve váčku je teď topologicky "venku", některé proteiny zůstávaní přichycené

Stavení raftu
V membráně se náhodně pohybují různé typy fosfolipidů a v blízkosti vhodných proteinů se pak ukotví

Pohyb buňky po podkladě
Jedna z možností pohybu je buď to kutálení ovládané povrchovými proteiny nebo
plazení pomocí cytoskeletu (z hlavní části)

Tolik ve zkratce...
Moje oblíbená věda...

Eleshar_Vermillion

Sosacek píše:a chtel jsi nosit vysoky podpadky a zensky saty?

(kdo to pochopi, ma u me lizatko!)

Taky u tebe mám lízátko:)

Jerson · Příspěvek od **Jerson** » 14. 10. 2007, 10:28

Sosacek píše:a chtel jsi nosit vysoky podpadky a zensky saty?

(kdo to pochopi, ma u me lizatko!)

lízátko nepotřebuju, ale vysvětlení by se mi hodilo.

Sosacek · Příspěvek od **Sosacek** » 14. 10. 2007, 11:24

Jerson:

to je v jednom skeci od monty pythonu. prijde tam chlapek oblecenej jako drevorubec, a celej peveckej sbor drevorubcu, a zacnou zpivat, v (mozna neumelem) prekladu

ref: jsem drevorubec a jsem v pohode, celou noc spim a celej den makam
je drevorubec a je v pohode, celou noc spi a celej den maka

kacim stromy, snim obed, jdu na zachod, ve ctvrtek jdu na nakup, a ... (normalni text)

(sbor opakuje)

ref.

kacim stromy, vesele poskakuju, rad sbiram divoke kvetiny,
oblelekam si zenske saty a poflakuju se po barech

sbor lehce nevericne opakuje.

ref.

kacim stromy, nosim vysoky podpatky, podvazky a podprsenku,
chtel bych bych divkou, jako ma draha matka.

sbor znechucene odejde, ten chlapek sam dozpiva refrem, a slecna co je tam s nim taky znechucene odejde.

z pozdjsi verzi to jeste zdrsnili, hlasi tam, ze by chtel byt divkou jako jehoi drahy otec.

original: http://video.google.com/videoplay?docid ... 3768138601

...

kdyz si predstavis Faskala, v tech podvazkach, jo ... tak ... eeeee ...

Příspěvek od **Faskal** » 11. 11. 2007, 14:33

Pokud máte zájem:
Rychlokurz problematiky geneticky modifikovaných organismů pro laiky
od Jaroslava Petra

GMO

Argonantus · Příspěvek od **Argonantus** » 4. 12. 2007, 10:19

tak já bych měl dotaz na biologickou sekci:

Co je stárnutí? Únava materiálu, nebo nějak naprogramovaný proces?

Příspěvek od **Faskal** » 4. 12. 2007, 10:23

Ptáš se na strašlivě složitou otázku, která má mnoho možných vrstev odpovědí.
Zajímá tě stárnutí na buněčné úrovni a proč se člověk nemůže dožít tísíců let, nebo třeba, proč se lidský vzhled a výkonnost postupem času mění, jak je s odumíráním buněk, nebo proč odchází nejdůležitější část lidského těla - mozek?

Nejvíc toho vím o buněčné problematice, o dalších věcech už mnohem míň.