Covid-19

[Eleshar_Vermillion]

Tak ono nějaké trasování kontaktů mělo smysl dejme tomu naposledy před 4, možná 6 měsíci. Máme skoro 30 tisíc lidí denně, positivita testů na 25 % (tj. pětinásobek toho, co by to mělo maximálně být).

[Jezus]

Ano, je to tak. Pro mě je to spíš "co se zase mělo dřív dělat líp" (stejně jako loni), než co by teď pomohlo.

Teď už můžeš akorát plošně testovat, omezovat kontakty (=zavírat) a modlit se, aby se vyčerpaly nehorší kolektivy a pomalu to kleslo někam, kde to stihneš alespoň posílat do nemocnic (případně pohřbívat).

[Eleshar_Vermillion]

Tak Němci už prakticky redefinovali své 3G na Geimpft, Genesen, Gestorben...

Mimo téma:
Jak je to s vakcínou proti chřipce? Znám ten balast kolem, že se to vyvíjí každý rok znovu na nějaký odhad budoucích variant a úspěšnost tedy kolísá, ale nikdy mě to úplně nezajímalo, protože jsem kdysi byl v kontaktu s nějakými zdravotními sestrami (ještě v době, kdy antivax bylo u nás dost okrajové téma), a ty mi to vždycky rozmlouvaly, že je to prý strašné svinstvo a je to k ničemu. Ale když teď vidím, kolik je antivaxerů (a zdaleka nejen covidiotických) mezi zdravotními sestrami u nás i ve světě, tak si říkám, zda to nestojí za úvahu.

[Antharon]

Eleshar: Ci to za to stoji to je otazne, kazdy rok ta ockuju najuspesnejsimi kmenmi z roku predchadzajuceho. Proti novym kmenom je vsak efektivita pomerne nizka, pretoze chripka velmi rychlo mutuje. Vakcina je vektorova a zda sa, ze asi velmi nekvalitna, pretoze stale znova a zvona sa vynoruju informacie o ludoch, ktori ochoreli z ockovania. Navyse to nie je ani velmi lacne.

U ludi ako ucitelky, alebo lekari to asi opodstatnenie ma, lebo prichadzaju do kontaktu s hromadou prenasacov. Pre inych je to asi velmi otazne, a hoci ma tento argument u korony neuveritelne vytaca, mozno je v tomto pripade lepsie boostovat prirodzenu imunitu, vela vitaminu C a caste umyvanie ruk (tajomstvo zdravia zdravotnych sestier). Chripka navyse nie je nejak extra nebezpecna a v pripade nakazy clovek proste ostane tyzden doma v posteli a pozrie si serial, ktory si na tuto prilezitost setril cely rok...

[Antharon]

Eleshar: Ci to za to stoji to je otazne, kazdy rok ta ockuju najuspesnejsimi kmenmi z roku predchadzajuceho. Proti novym kmenom je vsak efektivita pomerne nizka, pretoze chripka velmi rychlo mutuje. Vakcina je vektorova a zda sa, ze asi velmi nekvalitna, pretoze stale znova a zvona sa vynoruju informacie o ludoch, ktori ochoreli z ockovania. Navyse to nie je ani velmi lacne.

U ludi ako ucitelky, alebo lekari to asi opodstatnenie ma, lebo prichadzaju do kontaktu s hromadou prenasacov. Pre inych je to asi velmi otazne, a hoci ma tento argument u korony neuveritelne vytaca, mozno je v tomto pripade lepsie boostovat prirodzenu imunitu, vela vitaminu C a caste umyvanie ruk (tajomstvo zdravia zdravotnych sestier). Chripka navyse nie je nejak extra nebezpecna a v pripade nakazy clovek proste ostane tyzden doma v posteli a pozrie si serial, ktory si na tuto prilezitost setril cely rok...

[Jezus]

Tohle běžné "podceňování chřipky" by mě taky mimochodem zajímalo. Já chápu, že mladého člověka s dobrou fyzičkou to nezabije, ale docela věřím těm odhadům "úmrtí s chřipkou" kolem 1 500 osob ("protože na něco ti staří umřít musí").

Navíc týden je imho kravina, která znamená přecházení nebo nedoléčení. ať si každý dělá co chce, ale docela by mě zajímaly důsledky přecházení chřipky (což se alespoň z části běžně děje). Nejsem doktor, ale mám pocit, že se mluvilo taky o tom, že to způsobuje dlouhodobější následky (byť samozřejmě úměrně nižší než covid).

Víc k věci - pokud jsou lidi navyklí, že očkování proti chřipce je v zásadě svinstvo, které si zdráhá píchnout i doktor, nelze se divit, že se dívají na očkování na covid zdráhavě.
Samozřejmě ta zdráhavost měla padnout, když se proočkovala půlka světa a výsledky jsou velice příznivé, ale tady je stopa, odkud se nedůvěra ve farma průmysl (a naopak podezření z nějakého loby) berou.

[PardGalen]

My to testování zrovna řešíme. U dcery ve třídě je několik nakažených včetně učitelky. Z hygieny dorazila zpráva, že se má dcera jít nechat otestovat mezi pátým až sedmým dnem (dřív ne, to by neplatilo). Když už tam jdeme tak se necháme otestovat také, ale je to jenom naše vůle z hygieny nic nedorazilo. Možná, že až dceři vyjde pozitivní test tak se ozvou, ale kdo ví. Tak nějak jsem tomu co se tu kolem děje přestal rozumět už dávno.

[Faskal]

Tak napříč, ta varianta ν (ne "v", ale řecké ν; anglicky nu, česky ný) vypadá nepříjemně, je zmutovaná až ke stopu a konvergentní evolucí dospěla ke spoustě mutací, které jsou v jiných variantách, a k mutacím, které pravděpodobně něco dělají, ale ještě se neví co.
Podle předběžných dat se velmi ochotně šíří a úspěšně přebíjí deltu. Bude nicméně potřeba počkat, jestli je to opravdu pravda, jedna z mutací způsobuje, že je - podobně jako alfa - tzv. S-dropout. To v praxi znamená, že je možné ji rozpoznat velmi snadno pomocí rutinních analýz PCR (platí, pokud se používá stejný typ materiálu, tzv. primerů). Z toho může plynout, že při sekvenacích se nadhodnotí poměř takových variant, protože vypadají na první pohled podezřele. Nicméně, většina nedávných strašidelných grafů vychází přímo z těch hrubých S-dropoutů, záchytů je v absolutních číslech relativně málo, ale už docela rozlezlých a trend je všude zdá se stejný.

Bude potřeba počkat na další data, asi nejlepší zdroj je v tuhle chvíli ten nature, co jsem postoval včera: https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w

Každopádně, teď uvidíme, jak teda umíme trasovat.

Očkování na chřipku má poněkud nízkou popularitu, důvodů bude víc. Jednak nejde očkovat na "chřipku", ale vždy jen na konkrétní kmen, či jejich kombinaci, přičemž očkování chrání dobře jenom na vybraný cíl, na vzdáleně příbuzné už tolik ne. Zatímco třeba covid se mění tzv. antigenním driftem, tedy pomalu a průběžně mutuje a mění se, tak chřipka se mění antigenním shiftem. Chřipka má na rozdíl od SARS-CoV-2 segmentovaný genom, což v praxi znamená, že je schopna mutovat paralelně - jednotlivé antigeny leží na různých segmentech, a když se potkají dva kmeny chřipky v jednom organismu, náhodně si promíchají segmenty. Díky tomu mají ohromnou genetickou variabilitu a schopnost prohledávat možné mutace.
Dále, chřipka je poměrně vážná nemoc, ale chřipce-podobných onemocnění je celá řada a v principu nejdou s jistotou rozpoznat jinak, než laboratorním vyšetřením. Takže člověk se jde očkovat na chřipku, pak chytí "chřipku", tedy něco úplně jiného, a vyvodí si, že očkování bylo k ničemu. Další věc je, že očkování proti chřipce nemá zas tak vysokou účinnost. A ještě, jak jsem psal, je potřeba očkovat proti konkrétním kmenům. Neočkuje se proti kmenům, co byly v minulé sezóně, ale udělá se kvalifikovaný odhad, co by mohlo kolovat následující sezónu, což ne vždy vyjde. Pak nevím, jak je to drahé u nás a ve světě, ale nějací lidi(tm) si stěžovali, že je to docela drahé a vyplatí se to jenom u seniorů. To je hodně "ale" na to, aby to byla populární vakcína.

[Faskal]

Jo, jo. Omikron je lepší.

[Eleshar_Vermillion]

https://www.novinky.cz/domaci/clanek/kd ... p-40379239
Těší mě, že Novinky opustily svou propagaci ivermektinu ve prospěch skutečného zpravodajství.

[Sosacek]

Si rikam, "to zas bude v aleji nablito".

A ten clanek ma 5767 komentaru

[Faskal]

... důvody, proč jsou ve WHO z omikronu vyplesklí, jsou dva. Jednak zřejmě úspěšně kompetuje s deltou, takže se šíří ještě rychleji. Pak to podle mutací vypadá, že dokáže částečně obcházet imunitu vytvořenou proti dřívějším variantám, je otázka, nakolik efektivně. Co jsem zaznamenal, tak už to přední laboratoře zkoumají, u delty měly pilotní experimenty snad do dvou týdnů, tak uvidíme.

Tahle varianta není blízce příbuzná jiným známým variantám, zaznamenal jsem odhady, že vychází z kmenu, který koloval někdy v polovině 2020 a pak nebyl detekovaný. Není moc divu, v Africe bylo sekvenování variant kulantně řečeno zřídkavé (Edit: i když tahle poznámka je ode mě nefér, protože v Jihoafrické republice, kde ji detekovali - což ale nemusí znamenat, že je přímo od nich, jenom ji tam našli - se při mezinárodním srovnání sekvenuje docela dost) . Doplňující možnost je, že tahle varianta dlouho seděla v pacientovi, co byl infikovaný, ale neměl funkční imunitu (vzhledem k prevalenci HIV v Africe nic neobvyklého), takže virus měl spoustu času mutovat.

Mutace vypadají takhle, je to dost best of jiné varianty. Nahoře jsou známé problémové mutace, dole jsou mutace, u kterých není známé, jestli něco dělají nebo ne. Omikron je uprostřed jako 21K B.1.1.529. Na obrázku jsou jenom mutace v proteinu S, který je nejdůležitější pro infekčnost a imunitu (očkování), funkce jiných proteinů zas tak dobře prozkoumané nejsou a teprve se uvidí, jestli tam má omikron něco zajímavého*.
(Obrázek jde rozkliknout.)

https://covariants.org/shared-mutations

Edit: * Kdyžtak něco tady: https://covariants.org/variants/21K

[Naoki]

Jinak dost koluje informace že přeskočili řecké písmeno Xi protože by to mohlo urazit Čínu - je to pravda nebo zase nějaký alt-right hoax a varianta Xi je někde zaznamenaná?

[ShadoWWW]

Není to Hoax. Xi Jinping je totiž anglická transkripce Si Ťin-pchinga, tak ji radši přeskočili.

[jjelen]

Není to Hoax. Xi Jinping je totiž anglická transkripce Si Ťin-pchinga, tak ji radši přeskočili.

Jen jestli to není opačně, aby nebyl uražen virus srovnáním s půem...