BIOLOGOVÉ!!!!!

O lidech, o vztazích, o politice, o názorech, o opicích a o ufonech.

Moderátor: Faskal

Odpovědět
Uživatelský avatar
Vallun
Příspěvky: 25365
Registrován: 14. 5. 2008, 09:40
Bydliště: Velká Praha
Kontaktovat uživatele:

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Vallun » 28. 1. 2019, 23:48

Kořenonožci, to by mohlo být ono...v roce 2002 jsme už biologii vůbec neměl:) S tou jsme skončil napsoledy v květnu 1999:)
Pokud chce někdo slyšet jen "ano" nebo "ne", tak jej nezajímá odpověď.
Eru je jediný Bůh a Tolkien je jeho prorok.
Non sub hominem,sed sub ius.
Pravda a láska zvítězí nad lží a nenávistí.
Nejsem odborník ve smyslu § 5 odst. 1 O.Z.

Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 5234
Registrován: 9. 5. 2005, 20:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs » 30. 1. 2019, 17:14

Je tohle to svinsvo co působí red tide?
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 30. 1. 2019, 18:21

Přímo tihle spíš ne, ale zástupci jejich sesterské skupiny. Dívám se, že se jmenuje Halvaria a patří do ní mimo jiné rozsivky a obrněnky, co jsou primárně zodpovědné za rudý příliv.

Dohromady se jmenují skupina SAR https://cs.wikipedia.org/wiki/SAR_(taxonomie)
Patří tam různá malá žoužel, prvoci, některé hnědé řasy, někteří bičíkovci, některé jednobuněčné "houby" (plíseň bramborová), ... prostě věci, které by střízlivý člověk nikdy nedal do jedné skupiny. Ale evoluce je hold mocná čarodějka.

Přiznám se, že jsem novou systematiku vnitřně nedokázal zpracovat.
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

komi
Příspěvky: 311
Registrován: 17. 8. 2012, 18:07

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od komi » 30. 1. 2019, 23:39

Jo, populární spirály s ještě populárnějšími zlatými řezy a fibonacciho posloupnostmi u kytek a semtam i u zviřátek, ty už jistě způsobily hromady bezesných nocí různým filosofům, matematikům a bůhví komu všemu. Přitom tak hezky by ta semínka u slunečnice vypadala v pravoúhlé mřížce, místo toho aby se tam objevovala postupně pootočená o nepěkný iracionální zlatý úhel :-)

Ale jinak tohle lešení mě překvapilo, je to fakt pozoruhodně rovnoběžné a docela i kolmé.Obrázek
To se matka příroda pochlapila a vzala do ruky i pravítko. Když oproti tomu uvážím třeba chaotickou strukturou našich kostí - tam si místo pravítka vzala nejspíš LSD.

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 31. 1. 2019, 02:08

Fakt, že jo. A ještě tam mají dvě takové (i když ta moje první teda vypadá jako podklad k tvému nálezu):
Obrázek
Obrázek

To mi připomnělo, že více čtverečků půjde najít i u jiných věcí, co využívají oxid křemičitý jako svou kostru, třeba mořské houby:
Obrázek
Některé houby mají úžasně pravidelnou síť, která vyztužuje jejich těla. Moc a moc fotek jsou v práci MODERN FORAMINIFERA ATTACHED TO HEXACTINELLID SPONGE MESHWORK ON THE WEST CANADIAN SHELF:COMPARISON WITH JURASSIC COUNTERPARTS FROM EUROPE: https://palaeo-electronica.org/2006_1/sponge/sponge.pdf

Třeba tato:
Obrázek

Asi by šly najít taky takovéto struktury, ty mě vlastně ani nenapadly, že jsou taky pravoúhlé (zrovna tento nejspíš bude kus sítě zezhora, ale kreslí se i osamoceně). To je taky z mořské houby:
Obrázek
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

Sosacek
Příspěvky: 21249
Registrován: 14. 7. 2004, 18:30

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Sosacek » 3. 2. 2019, 14:27

Fotka DNA

Obrázek
This place is a message... and part of a system of messages ...pay attention to it!
Sending this message was important to us. We considered ourselves to be a powerful culture.
This place is not a place of honor... no highly esteemed deed is commemorated here... nothing valued is here.
What is here was dangerous and repulsive to us. This message is a warning about danger.

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 3. 2. 2019, 15:46

Mám pocit, že ... pár let zpátky... jsme to někde řešili, ale nemůžu to najít, tak asi ne.

Strukturu DNA jsme až do nedávna studovali prakticky výhradně pomocí rentgenové krystalografie. Ta sice dává hezké výsledky, ale tak, že ze spousty teček necháte počítač spočítat strukturu.

Tohle je (od ksichtu) kryo-EM, typ elektronové mikroskopie. Ta sice také není úplně normální, protože se díváte pomocí elektronů, ale více či méně je to "normální" mikroskopie, kdy se na něco fakt můžete reálně "podívat".

Když nahlížím na internet, už je podobných studií víc.

Edit:
hm, tak ono už je to vlastně relativně staré.
Dneska jsme tady: Motifs beyond B-form DNA for nanotechnology. (A) A vertical stack of five Holliday junctions. (B) A pseudohelical structure that runs along the direction of the base pairs. (C) A bent helix and distorted cross-over due to an omitted base pair (Lower) and a typical cross-over without omission (Upper). (D) Crevices formed by splayed-out helices due to the absence of stabilizing cross-overs.
Takže šedá plocha je skutečně naměřená oblast, model uvnitř je barevně.
Obrázek

https://www.pnas.org/content/109/49/20012
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 5234
Registrován: 9. 5. 2005, 20:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs » 3. 2. 2019, 18:47

Rentgenová krystalografie má ten nedostatek, že je to krystalografie a DNA se přirozeně jako krystal nevyskytuje. CryEM má ten nedostatek, že má dost nízké rozlišení (pod 0,3 nm to moc nejde, většinou ještě horší, RTG krystalografie i pod 0,1 nm) a taky se měří mražený vzorek. Obé nemusí nutně odpovídat molekule v jejím přitozeném prostředí.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 3. 2. 2019, 19:02

To jo, no.
Že má kryo-EM nízké rozlišení, je důvod, proč trvalo relativně dlouho, než jsme tu DNA viděli.
Nicméně to, že je vzorek mražený, zas tak nevadí. Artefaktům se nikdy nedokážeš ubránit úplně, ale kryo-EM je v rámci možností věrným obrazem skutečnosti.

Ten Sosáčkův příklad ukazuje "nepřirozenou" konformaci A (podle pravidelných rozestupů), která typicky vzniká při dehydrataci vzorku, zatímco ten nový je konformace B (jak je patrné z obrázku C a D), která se přirozeně vyskytuje v buňce.

Tahák ke konformacím:
Obrázek
A-B-Z
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 5234
Registrován: 9. 5. 2005, 20:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs » 3. 2. 2019, 19:21

Nejlepším obrazem skutečnosti je NMR (vzorek v roztoku!), ale to má celou řadu svých nedostatků.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 3. 2. 2019, 21:47

... převratnost Sosáčkova obrázku byla v tom, že tehdy se povedlo poprve DNA fakt "vidět", protože kryo-EM je s jistým uzarděním (jsou tam elektrony) možné označit za mikroskopii, a s tou má ze školy zkušenosti každý. NMR je super, ale získáš tohle:
Obrázek

Pak použiješ černou magii a vyjde ti struktura:
Obrázek
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 5234
Registrován: 9. 5. 2005, 20:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs » 4. 2. 2019, 22:23

Jo, ale je to struktura toho jak to víceméně reálně vypadá. Koneckonců černou magii používáš i pro řešení fázového problému v RTG krystalografii a v cryoEM 3D strukturu skládáš z tisíců snímků různě natočenýchz molekul, že.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!

Uživatelský avatar
Vallun
Příspěvky: 25365
Registrován: 14. 5. 2008, 09:40
Bydliště: Velká Praha
Kontaktovat uživatele:

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Vallun » 8. 2. 2019, 18:14

neposoudím kvalitu zdroje, ale lčánek je dosti zajímavý...

https://www.majesticanimals.net/512-yea ... tjdNNzxAh0
Pokud chce někdo slyšet jen "ano" nebo "ne", tak jej nezajímá odpověď.
Eru je jediný Bůh a Tolkien je jeho prorok.
Non sub hominem,sed sub ius.
Pravda a láska zvítězí nad lží a nenávistí.
Nejsem odborník ve smyslu § 5 odst. 1 O.Z.

Sosacek
Příspěvky: 21249
Registrován: 14. 7. 2004, 18:30

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Sosacek » 23. 3. 2019, 19:43

Jak se doplnuje glykogen, kdyz nemas prebytecnou glukozu? Glukoneogenezi, nebo nejak jinak?
This place is a message... and part of a system of messages ...pay attention to it!
Sending this message was important to us. We considered ourselves to be a powerful culture.
This place is not a place of honor... no highly esteemed deed is commemorated here... nothing valued is here.
What is here was dangerous and repulsive to us. This message is a warning about danger.

Uživatelský avatar
Faskal
Příspěvky: 7614
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Laboratoř RNA Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal » 24. 3. 2019, 00:37

Svaly mají několik zdrojů energie. Když se to hodně zjednoduší, tak pro netrénovaného jedince platí zhruba, že...
volné ATP slouží jako přímý zdroj energie (a bude zmíněno ještě mnohokrát), jeho zásoby jsou spíše mizivé.
ATP se doplňuje z kreatin-fosfátu, jeho zásoby jsou na řádově vteřiny
Tyto zdroje nepotřebují kyslík.

Následně se začne zpracovávat glukóza na ATP. Té je ve svalu docela dost, ale hlavně se průběžně doplňuje z krve. Glukóza se zpracovává dvěma způsoby:
Aerobně, kde se molekula glukózy plně spotřebuje, toto je výrazně (cca 15x) efektivnější než anaerobní způsob získávání energie z glukózy, ale je to limitováno dostupností kyslíku.
Anaerobně, kdy se glukóza jenom rozštěpí na kyselinu mléčnou, která se pošle z buňky do krve a z ní do jater, kde se z ní znovu poskládá glukóza. Tento proces dodá svalu jenom relativně málo energie a je limitován překyselením svalu, ke kterému dochází při tomto procesu. Dokud jsou ale zásoby glukózy dostatečné, dá se fungovat "na dluh" kyslíku.

Glukóza se obnovuje z glykogenu, který je uložený ve svalech a v játrech, jeho zásoby jsou odhadem na hodinu-dvě intenzivního cvičení.

Paralelně se ve svalech spotřebovávají aminokyseliny, případně rovnou celé proteiny, za tvorby ATP. Toto je limitováno jednak tím, že volných aminokyselin je poměrně málo (a musí se průběžně doplňovat z potravy) a při likvidování proteinů dochází k úbytku svalů - pokud je tělo nuceno získávat energii z vlastních proteinů, je něco hodně špatně. Druhou limitací je, že je potřeba se zbavovat amino-skupin. Ty se navážou na aminokyselinu alanin z vzniku alfa-ketoglukarátu a pošlou do jater, kde se z nich udělá glukóza a močovina.

Při svalové práci se tedy spotřebovává glukóza. Pokud není dodávána z potravy, doplňuje se ještě nějakou dobu glukoneogenezí: recyklací kyseliny mléčné z anaerobního zpracování glukózy, případně z alaninového cyklu nebo glycerolu (minoritní složka tuku). Když ale glukóza došla, tak došla.

Alternativní zdroj energie/ATP ke glukóze jsou ketosloučeniny vznikající z tuku. Ty se začnou používat po desítkách minut námahy. Jejich výhoda je, že jejich zásoby jsou většinou značné, nevýhodou, že ke svému dalšímu zpracování na ATP potřebují kyslík. Rozkládáním tuku není možné získat stavební složky glukózy (s výjimkou té trošky glycerolu, co mastné kyseliny drží pohromadě), což znamená, že svaly nejsou schopny fungovat v anaerobním módu, ale tělo na ketosloučeninách jinak fungovat dokáže.

Glykogen je jinak zásobní molekula, podobná rostlinnému škrobu - škrob je lineární, glykogen je rozvětvený polymer glukózy. Větvení má smysl, enzym štěpí vždycky jenom konce vláken, štěpení glykogenu je tedy možné paralelizovat a získávat z něj energii rychleji než ze škrobu. Protože je glykogen zásobní, vzniká při přebytku glukózy, což je řízeno hormonálně. Přebytky glukózy jsou především z přebytků cukrů, případně z přebytku proteinů.

Tréningem/výživou je možné s jednotlivými parametry značně pohýbat. Především lze tréningem zvětšit množství svalových vláken a také upravit poměr svalových vláken, co preferenčně využívají aerobní/anaerobní metabolismus, což u běžců odpovídá vytrvalcům vs sprintecům. U výběru preferencí svalových vláken se žongluje s hledáním vhodného poměru pro schopnost krátkodobě vydat velké množství síly za jednotku času versus schopnost dlouhodobě využívat menší množství síly za jednotku času. Dále jde vylepšit množství zásob, které svaly mají, případně je předem nakrmit, odtud suplementy s kreatinem či (malto-)dextrinem* (před-naštípaným škrobem dodávajícím glukózu=> glykogen); kreatin navíc slouží jako signál (jeden z nich) pro růst svalů.

tl;dr
když dojde glukóza z potravy a glykogenu, je možné ji ještě chvilku doplňovat recyklací produktů neefektivního (nebo asi lépe nehospodárného) anaerobního metabolismu svalů. Pak je potřeba přejít na využívání tuků, které ale vyžaduje aerobní metabolismus.

edit:
* sakra chyba, měl jsem tam dextrózu, což je samozřejmě synonymum pro glukózu
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: [SvětDračáku] {PbP} Kobky Šíleného mága - Turan.

Odpovědět

Zpět na „Realita a pseudorealita“

Kdo je online

Uživatelé prohlížející si toto fórum: Žádní registrovaní uživatelé a 1 host