BIOLOGOVÉ!!!!!

O lidech, o vztazích, o politice, o názorech, o opicích a o ufonech.

Moderátor: Faskal

Odpovědět
Uživatelský avatar
midewiwin
Příspěvky: 4816
Registrován: 18. 12. 2006, 09:56

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od midewiwin »

Ty tabulky - čirá nádhera.
Čas neexistuje.
Uživatelský avatar
Vallun
Příspěvky: 32272
Registrován: 14. 5. 2008, 10:40
Bydliště: Velká Praha
Kontaktovat uživatele:

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Vallun »

Kořenonožci, to by mohlo být ono...v roce 2002 jsme už biologii vůbec neměl:) S tou jsme skončil napsoledy v květnu 1999:)
Pokud chce někdo slyšet jen "ano" nebo "ne", tak jej nezajímá odpověď.
Eru je jediný Bůh a Tolkien je jeho prorok.
Non sub hominem,sed sub ius.
Pravda a láska zvítězí nad lží a nenávistí.
Nejsem odborník ve smyslu § 5 odst. 1 O.Z.
Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 6292
Registrován: 9. 5. 2005, 21:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs »

Je tohle to svinsvo co působí red tide?
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!
Uživatelský avatar
Faskal
Moderátor
Příspěvky: 9045
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal »

Přímo tihle spíš ne, ale zástupci jejich sesterské skupiny. Dívám se, že se jmenuje Halvaria a patří do ní mimo jiné rozsivky a obrněnky, co jsou primárně zodpovědné za rudý příliv.

Dohromady se jmenují skupina SAR https://cs.wikipedia.org/wiki/SAR_(taxonomie)
Patří tam různá malá žoužel, prvoci, některé hnědé řasy, někteří bičíkovci, některé jednobuněčné "houby" (plíseň bramborová), ... prostě věci, které by střízlivý člověk nikdy nedal do jedné skupiny. Ale evoluce je hold mocná čarodějka.

Přiznám se, že jsem novou systematiku vnitřně nedokázal zpracovat.
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: Tannhäuserova brána - Claudius II, Karak - Erbald.
Uživatelský avatar
komi
Příspěvky: 674
Registrován: 17. 8. 2012, 19:07

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od komi »

Jo, populární spirály s ještě populárnějšími zlatými řezy a fibonacciho posloupnostmi u kytek a semtam i u zviřátek, ty už jistě způsobily hromady bezesných nocí různým filosofům, matematikům a bůhví komu všemu. Přitom tak hezky by ta semínka u slunečnice vypadala v pravoúhlé mřížce, místo toho aby se tam objevovala postupně pootočená o nepěkný iracionální zlatý úhel :-)

Ale jinak tohle lešení mě překvapilo, je to fakt pozoruhodně rovnoběžné a docela i kolmé.Obrázek
To se matka příroda pochlapila a vzala do ruky i pravítko. Když oproti tomu uvážím třeba chaotickou strukturou našich kostí - tam si místo pravítka vzala nejspíš LSD.
Uživatelský avatar
Faskal
Moderátor
Příspěvky: 9045
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal »

Fakt, že jo. A ještě tam mají dvě takové (i když ta moje první teda vypadá jako podklad k tvému nálezu):
Obrázek
Obrázek

To mi připomnělo, že více čtverečků půjde najít i u jiných věcí, co využívají oxid křemičitý jako svou kostru, třeba mořské houby:
Obrázek
Některé houby mají úžasně pravidelnou síť, která vyztužuje jejich těla. Moc a moc fotek jsou v práci MODERN FORAMINIFERA ATTACHED TO HEXACTINELLID SPONGE MESHWORK ON THE WEST CANADIAN SHELF:COMPARISON WITH JURASSIC COUNTERPARTS FROM EUROPE: https://palaeo-electronica.org/2006_1/sponge/sponge.pdf

Třeba tato:
Obrázek

Asi by šly najít taky takovéto struktury, ty mě vlastně ani nenapadly, že jsou taky pravoúhlé (zrovna tento nejspíš bude kus sítě zezhora, ale kreslí se i osamoceně). To je taky z mořské houby:
Obrázek
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: Tannhäuserova brána - Claudius II, Karak - Erbald.
Sosacek
Příspěvky: 25732
Registrován: 14. 7. 2004, 19:30

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Sosacek »

Fotka DNA

Obrázek
But nobody came.
Uživatelský avatar
Faskal
Moderátor
Příspěvky: 9045
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal »

Mám pocit, že ... pár let zpátky... jsme to někde řešili, ale nemůžu to najít, tak asi ne.

Strukturu DNA jsme až do nedávna studovali prakticky výhradně pomocí rentgenové krystalografie. Ta sice dává hezké výsledky, ale tak, že ze spousty teček necháte počítač spočítat strukturu.

Tohle je (od ksichtu) kryo-EM, typ elektronové mikroskopie. Ta sice také není úplně normální, protože se díváte pomocí elektronů, ale více či méně je to "normální" mikroskopie, kdy se na něco fakt můžete reálně "podívat".

Když nahlížím na internet, už je podobných studií víc.

Edit:
hm, tak ono už je to vlastně relativně staré.
Dneska jsme tady: Motifs beyond B-form DNA for nanotechnology. (A) A vertical stack of five Holliday junctions. (B) A pseudohelical structure that runs along the direction of the base pairs. (C) A bent helix and distorted cross-over due to an omitted base pair (Lower) and a typical cross-over without omission (Upper). (D) Crevices formed by splayed-out helices due to the absence of stabilizing cross-overs.
Takže šedá plocha je skutečně naměřená oblast, model uvnitř je barevně.
Obrázek

https://www.pnas.org/content/109/49/20012
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: Tannhäuserova brána - Claudius II, Karak - Erbald.
Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 6292
Registrován: 9. 5. 2005, 21:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs »

Rentgenová krystalografie má ten nedostatek, že je to krystalografie a DNA se přirozeně jako krystal nevyskytuje. CryEM má ten nedostatek, že má dost nízké rozlišení (pod 0,3 nm to moc nejde, většinou ještě horší, RTG krystalografie i pod 0,1 nm) a taky se měří mražený vzorek. Obé nemusí nutně odpovídat molekule v jejím přitozeném prostředí.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!
Uživatelský avatar
Faskal
Moderátor
Příspěvky: 9045
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal »

To jo, no.
Že má kryo-EM nízké rozlišení, je důvod, proč trvalo relativně dlouho, než jsme tu DNA viděli.
Nicméně to, že je vzorek mražený, zas tak nevadí. Artefaktům se nikdy nedokážeš ubránit úplně, ale kryo-EM je v rámci možností věrným obrazem skutečnosti.

Ten Sosáčkův příklad ukazuje "nepřirozenou" konformaci A (podle pravidelných rozestupů), která typicky vzniká při dehydrataci vzorku, zatímco ten nový je konformace B (jak je patrné z obrázku C a D), která se přirozeně vyskytuje v buňce.

Tahák ke konformacím:
Obrázek
A-B-Z
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: Tannhäuserova brána - Claudius II, Karak - Erbald.
Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 6292
Registrován: 9. 5. 2005, 21:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs »

Nejlepším obrazem skutečnosti je NMR (vzorek v roztoku!), ale to má celou řadu svých nedostatků.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!
Uživatelský avatar
Faskal
Moderátor
Příspěvky: 9045
Registrován: 20. 11. 2006, 20:59
Bydliště: Praha

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Faskal »

... převratnost Sosáčkova obrázku byla v tom, že tehdy se povedlo poprve DNA fakt "vidět", protože kryo-EM je s jistým uzarděním (jsou tam elektrony) možné označit za mikroskopii, a s tou má ze školy zkušenosti každý. NMR je super, ale získáš tohle:
Obrázek

Pak použiješ černou magii a vyjde ti struktura:
Obrázek
... ano, chtěl jsem zničit svět. Ale ne takhle.
Staré zápisy z her, aktuálně: Tannhäuserova brána - Claudius II, Karak - Erbald.
Uživatelský avatar
Fritzs
Příspěvky: 6292
Registrován: 9. 5. 2005, 21:47
Bydliště: Brno

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Fritzs »

Jo, ale je to struktura toho jak to víceméně reálně vypadá. Koneckonců černou magii používáš i pro řešení fázového problému v RTG krystalografii a v cryoEM 3D strukturu skládáš z tisíců snímků různě natočenýchz molekul, že.
-I don't suffer from insanity. I enjoy every minute of it.

-If violence isn't solving your problems then you aren't using it enough.

-Jestliže je hlad nejlepší kuchař, pak je smrt nejlepší lékař!
Uživatelský avatar
Vallun
Příspěvky: 32272
Registrován: 14. 5. 2008, 10:40
Bydliště: Velká Praha
Kontaktovat uživatele:

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Vallun »

neposoudím kvalitu zdroje, ale lčánek je dosti zajímavý...

https://www.majesticanimals.net/512-yea ... tjdNNzxAh0
Pokud chce někdo slyšet jen "ano" nebo "ne", tak jej nezajímá odpověď.
Eru je jediný Bůh a Tolkien je jeho prorok.
Non sub hominem,sed sub ius.
Pravda a láska zvítězí nad lží a nenávistí.
Nejsem odborník ve smyslu § 5 odst. 1 O.Z.
Sosacek
Příspěvky: 25732
Registrován: 14. 7. 2004, 19:30

Re: BIOLOGOVÉ!!!!!

Příspěvek od Sosacek »

Jak se doplnuje glykogen, kdyz nemas prebytecnou glukozu? Glukoneogenezi, nebo nejak jinak?
But nobody came.
Odpovědět

Zpět na „Realita a pseudorealita“

Kdo je online

Uživatelé prohlížející si toto fórum: Žádní registrovaní uživatelé a 13 hostů